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Apr 26, 2024

Rilevazione del virus respiratorio nel tratto respiratorio superiore di comunità asintomatiche

BMC Infectious Diseases volume 22, Numero articolo: 411 (2022) Cita questo articolo 1572 Accessi 3 Citazioni 46 Dettagli metriche altmetriche La prevalenza della positività al virus nelle vie respiratorie superiori

BMC Infectious Diseases volume 22, numero articolo: 411 (2022) Citare questo articolo

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Dettagli sulle metriche

La prevalenza della positività al virus nel tratto respiratorio superiore degli anziani asintomatici che vivono in comunità rimane sfuggente. Il nostro obiettivo era studiare la prevalenza della positività alla PCR del virus respiratorio negli anziani asintomatici residenti in comunità utilizzando campioni di saliva e tamponi nasofaringei e orofaringei.

Abbiamo analizzato 504 adulti residenti in comunità di età ≥ 65 anni che erano ambulatoriali e arruolati in uno studio trasversale condotto da febbraio a dicembre 2018 nella città di Nagasaki, in Giappone. Quattordici virus respiratori sono stati identificati nei campioni di saliva, nasofaringei e orofaringei utilizzando test PCR multiplex.

Le prevalenze di positività alla PCR per rinovirus, influenza A, enterovirus e qualsiasi virus respiratorio sono state del 12,9% (IC 95%: 10,1–16,1%), 7,1% (IC 95%: 5,1–9,8%), 6,9% (IC 95%: 4,9–9,5%) e 25,2% (IC 95%: 21,5–29,2%), rispettivamente. Il rinovirus è stato rilevato nel 21,5% dei soggetti, l'influenza A nel 38,9% dei soggetti, l'enterovirus nel 51,4% dei soggetti e qualsiasi virus nel 32,3% dei soggetti utilizzando solo il campionamento della saliva.

Le prevalenze di diversi virus respiratori erano superiori alle percentuali riportate in precedenza nei campioni faringei di adulti più giovani. Il campionamento della saliva è un metodo potenzialmente utile per il rilevamento del virus respiratorio nelle popolazioni asintomatiche.

Rapporti di revisione tra pari

L’implementazione della reazione a catena della polimerasi (PCR) in contesti clinici più ampi facilita il rilevamento tempestivo e accurato dei virus respiratori, rivelando i virus respiratori come patogeni comuni della polmonite acquisita in comunità [1,2,3]. Alcuni studi hanno riportato la prevalenza della positività al virus nelle vie respiratorie superiori di soggetti asintomatici [4,5,6]; tuttavia, la prevalenza tra gli anziani che vivono in comunità suscettibili a malattie gravi quando infetti deve ancora essere studiata.

Il rilevamento virale respiratorio nel rinofaringe utilizzando metodi biologici molecolari è un metodo standard per rilevare le infezioni respiratorie virali [7]. Tuttavia, i campioni di saliva sono potenziali campioni alternativi; il campionamento della saliva è meno invasivo ed è associato a un rischio inferiore di trasmissione rispetto al campionamento con tampone nasofaringeo (NP). Il beneficio del campionamento della saliva per il rilevamento del virus basato sulla PCR è stato segnalato in pazienti infetti da virus respiratori comuni e dalla sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2) [8,9,10,11,12].

L'obiettivo principale di questo studio era di indagare la prevalenza del rilevamento tramite PCR di virus respiratori negli anziani asintomatici residenti in comunità in Giappone. L'obiettivo secondario era esplorare il possibile utilizzo della saliva in aggiunta al campionamento faringeo per la sorveglianza della prevalenza nelle popolazioni asintomatiche.

Questa analisi è stata implementata nell’ambito del seguente studio esistente: “La bassa prevalenza di pneumococco tra le persone anziane che vivono in comunità: uno studio trasversale in Giappone” [13]. Tutti i metodi sono stati condotti in conformità con la Dichiarazione di Helsinki e lo studio è stato approvato dal Comitato di revisione etica dell'Istituto di medicina tropicale, Università di Nagasaki, Nagasaki, Giappone, e dai comitati di revisione istituzionale di ciascuna struttura di studio. Il consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i partecipanti o dalle loro famiglie. Lo studio è stato condotto da febbraio 2018 a dicembre 2018 nella città di Nagasaki, in Giappone. Abbiamo incluso gli anziani residenti in comunità di età ≥ 65 anni che erano in grado di deambulare e frequentavano visite cliniche regolari o visite di riabilitazione ambulatoriale presso 4 ospedali nella città di Nagasaki, in Giappone. Abbiamo escluso le persone con febbre o qualsiasi sintomo di infezione del tratto respiratorio superiore, le persone che hanno ricevuto un trattamento antibiotico nei 30 giorni precedenti e le persone che sono state ricoverate in ospedale o in una struttura di assistenza a lungo termine per ≥ 7 giorni nei 30 giorni precedenti. Le informazioni demografiche e cliniche dettagliate dei 504 partecipanti sono state descritte in precedenza [13]. I campioni NP e orofaringei (OP) sono stati ottenuti utilizzando due tamponi: un campione dal rinofaringe utilizzando un tampone sterilizzato con asta in alluminio (TE2201) (Eiken Chemical Co., Tokyo, Giappone) e un altro campione dall'orofaringe utilizzando un tampone sterilizzato con un albero di legno (TE8201) (Eiken Chemical Co., Tokyo, Giappone). Questi tamponi sono stati immediatamente posti individualmente in 1 ml di terreno latte scremato-triptone-glucosio-glicerolo (STGG) [14]. Ai partecipanti è stato chiesto di sputare all'interno di un contenitore per espettorato sterilizzato (DE2000) (Eiken Chemical Co., Tokyo, Giappone) per raccogliere la saliva pura senza espettorato. I dettagli sull'uso di questi tamponi sterilizzati e contenitori per espettorato sono disponibili online presso il produttore [15]. I campioni sono stati raccolti da ricercatori o infermieri di ricerca qualificati. Gli acidi nucleici virali sono stati estratti utilizzando un kit QIAamp viral RNA Mini (QIAGEN Inc., Valencia, CA, USA) e un QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN Inc., Valencia, CA, USA) e i seguenti quattordici virus respiratori sono stati sottoposti a screening con multiplex Saggi PCR utilizzando un kit One Step RT-PCR (QIAGEN Inc., Valencia, CA, USA) per virus RNA e GoTaq Flexi DNA Polymerase (Promega, San Luis Obispo, CA, USA) e PCR Nucleotide Mix (Promega, San Luis Obispo , CA, USA) per i virus a DNA, come descritto in precedenza [16]: influenza A, influenza B, virus respiratorio sinciziale (RSV), metapneumovirus umano (hMPV), virus parainfluenzali di tipo 1–4 (PIV-1, PIV-2, PIV-3 e PIV-4), rinovirus, coronavirus 229E, OC43 (coronavirus umano comune [HCoV]), adenovirus, bocavirus ed enterovirus. Un file aggiuntivo 1 mostra la sensibilità (limite di rilevamento) della PCR multiplex [vedi file aggiuntivo 1]. La prevalenza della positività alla PCR per i virus respiratori è stata definita come la prevalenza totale rilevata in almeno un campione NP, OP e/o saliva. Il calcolo della prevalenza della positività alla PCR è mostrato nel file aggiuntivo 2: Fig. S1. Il coefficiente kappa di Cohen (κ) è stato calcolato per misurare la concordanza tra ciascuna coppia di siti di campionamento.